Neben einem geschwächten Immunsystem spielen wahrscheinlich Malassezia-Pilze bei der Entstehung des seborrhoischen Ekzems eine Rolle. Sie gehören zur normalen Hautflora und ernähren sich vom Talg der Haut. Ihre Ausscheidungen können durch die Hautbarriere dringen, worauf ein gestörtes Immunsystem mit einer Entzündungsreaktion reagiert.